In vitro diagnostic test systems — Requirements and recommendations for detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) by nucleic acid amplification methods

This document provides requirements and recommendations for the design, development, verification, validation and implementation of analytical tests for detecting the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) using nucleic acid amplification. It addresses pre-examination, examination and post-examination process steps for human specimens. This document is applicable to medical laboratories. It is also intended to be used by in vitro diagnostic developers and manufacturers, as well as by institutions and organizations supporting SARS-CoV-2 research and diagnostics. This document does not apply to environmental samples.

Systèmes d’essai pour diagnostic in vitro — Exigences et recommandations pour la détection du coronavirus 2 associé au syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) par des méthodes d’amplification des acides nucléiques

Le présent document fournit des exigences et des recommandations pour la conception, le développement, la vérification, la validation et la mise en œuvre d’analyses afin de détecter le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS‑CoV‑2) au moyen de l’amplification de l’acide nucléique. Il aborde les étapes du processus préanalytique, de l’analyse et du processus postanalytique pour des spécimens humains. Le présent document s’applique aux laboratoires de biologie médicale. Il est également destiné aux concepteurs et fabricants de diagnostics in vitro, ainsi qu’aux institutions et aux organisations soutenant la recherche et le diagnostic du SARS‑CoV‑2. Le présent document ne s’applique pas aux échantillons environnementaux.

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Published
Publication Date
18-Apr-2022
Current Stage
9020 - International Standard under periodical review
Start Date
15-Apr-2025
Completion Date
15-Apr-2025
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Technical specification
ISO/TS 5798:2022 - In vitro diagnostic test systems — Requirements and recommendations for detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) by nucleic acid amplification methods Released:4/19/2022
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ISO/TS 5798:2022 - In vitro diagnostic test systems — Requirements and recommendations for detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) by nucleic acid amplification methods Released:23. 06. 2022
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REDLINE ISO/TS 5798:2022 - In vitro diagnostic test systems — Requirements and recommendations for detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) by nucleic acid amplification methods Released:23. 06. 2022
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Standards Content (Sample)


TECHNICAL ISO/TS
SPECIFICATION 5798
First edition
2022-04
In vitro diagnostic test systems —
Requirements and recommendations
for detection of severe acute
respiratory syndrome coronavirus 2
(SARS-CoV-2) by nucleic acid
amplification methods
Systèmes d’essai pour diagnostic in vitro — Exigences et
recommandations pour la détection du coronavirus 2 associé au
syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) par des méthodes
d’amplification des acides nucléiques
Reference number
© ISO 2022
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CP 401 • Ch. de Blandonnet 8
CH-1214 Vernier, Geneva
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Email: copyright@iso.org
Website: www.iso.org
Published in Switzerland
ii
Contents Page
Foreword .v
Introduction . vi
1 Scope . 1
2 Normative references . 1
3 Terms and definitions . 1
4 Overview . 7
4.1 SARS-CoV-2 . 7
4.1.1 General . 7
4.1.2 Pre-examination . 9
4.1.3 Examination — Overview . 9
4.1.4 Post-examination . 11
4.2 Nucleic acid amplification methods . 11
4.2.1 Reverse transcription qPCR (RT-qPCR) . 11
4.2.2 Reverse transcription digital PCR (RT-dPCR) .12
4.2.3 Isothermal amplification methods .12
5 Laboratory requirements .12
5.1 General .12
5.2 Biosafety requirements . 13
5.2.1 Laboratory area . 13
5.2.2 Risk control . 13
5.2.3 Personal protective equipment (PPE) . 13
5.3 General laboratory set-up .13
5.4 Instrumentation . 14
5.5 Laboratory personnel . 14
6 Design and development .14
6.1 Customer, patient and stakeholder needs . 14
6.2 Intended use of analytical test . 14
6.3 Institutional guideline strategy . 15
6.3.1 Laboratory developed tests (LDTs) versus in vitro diagnostic medical
devices (IVD medical devices) . 15
6.3.2 Emergency use authorization . 15
6.4 Clinical strategy . 15
6.5 Design and development planning . 16
6.5.1 Pre-examination of respiratory specimens for SARS-CoV-2 testing. 16
6.5.2 Examination design specifications (analytical test specifications) .22
6.5.3 Design risk management . 27
6.6 Optimization of reagents and methods .28
6.6.1 Selection of SARS-CoV-2 target sequences .28
6.6.2 Potential impact of variants of concern (VOCs) on the quality of NAAT
diagnostic methods for detecting SARS-CoV-2.28
6.6.3 Selection of amplification methods .28
6.6.4 Design and selection of primers .28
6.6.5 Optimization of the reaction system .29
6.6.6 Determination of cut-off values .29
6.6.7 Verification and validation of test design .29
7 Verification for patient care .31
7.1 General . 31
7.2 Confirmation of analytical performance characteristics . 31
7.2.1 Accuracy . 31
7.2.2 Limit of detection (LOD) . 31
7.2.3 Inclusivity . 32
7.2.4 Specificity . 32
iii
7.2.5 Robustness . . . 32
7.3 Clinical evidence . 33
8 Validation for patient care . .33
8.1 General consideration . 33
8.2 Clarification of the intended use . 33
8.3 Performance with clinical specimens or samples .34
9 Design transfer to production .34
10 Implementation and use in the laboratory and reporting of results .34
10.1 Implementation and use in the laboratory .34
10.2 Reporting and interpretation of results . 35
11 Quality assurance .36
11.1 Performance monitoring . 36
11.2 Design change including optimization of analytical test .36
11.3 Interlaboratory comparison . 37
Annex A (informative) Nucleic acid amplification techniques .38
Bibliography .41
iv
Foreword
ISO (the International Organization for Standardization) is a worldwide federation of national standards
bodies (ISO member bodies). The work of preparing International Standards is normally carried out
through ISO technical committees. Each member body interested in a subject for which a technical
committee has been established has the right to be represented on that committee. International
organizations, governmental and non-governmental, in liaison with ISO, also take part in the work.
ISO collaborates closely with the International Electrotechnical Commission (IEC) on all matters of
electrotechnical standardization.
The procedures used to develop this document and those intended for its further maintenance are
described in the ISO/IEC Directives, Part 1. In particular, the different approval criteria needed for the
different types of ISO documents should be noted. This document was drafted in accordance with the
editorial rules of the ISO/IEC Directives, Part 2 (see www.iso.org/directives).
Attention is drawn to the possibility that some of the elements of this document may be the subject of
patent rights. ISO shall not be held responsible for identifying any or all such patent rights. Details of
any patent rights identified during the development of the document will be in the Introduction and/or
on the
...


SPÉCIFICATION ISO/TS
TECHNIQUE 5798
Première édition
2022-04
Systèmes d’essai pour diagnostic
in vitro — Exigences et
recommandations pour la détection
du coronavirus 2 du syndrome
respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2)
au moyen de méthodes d’amplification
de l’acide nucléique
In vitro diagnostic test systems — Requirements and
recommendations for detection of severe acute respiratory syndrome
coronavirus 2 (SARS-CoV-2) by nucleic acid amplification methods
Numéro de référence
DOCUMENT PROTÉGÉ PAR COPYRIGHT
© ISO 2022
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être demandée à l’ISO à l’adresse ci-après ou au comité membre de l’ISO dans le pays du demandeur.
ISO copyright office
Case postale 401 • Ch. de Blandonnet 8
CH-1214 Vernier, Genève
Tél.: +41 22 749 01 11
E-mail: copyright@iso.org
Web: www.iso.org
Publié en Suisse
ii
Sommaire Page
Avant-propos .v
Introduction . vi
1 Domaine d'application .1
2 Références normatives .1
3 Termes et définitions . 1
4 Vue d’ensemble .7
4.1 SARS-CoV-2 . 7
4.1.1 Généralités . 7
4.1.2 Préanalyse . 9
4.1.3 Analyse — Vue d’ensemble . 9
4.1.4 Phase postanalytique . 11
4.2 Méthodes d’amplification de l’acide nucléique . 11
4.2.1 qPCR à transcription inverse (RT-qPCR) . 11
4.2.2 PCR numérique à transcription inverse (RT-dPCR) .12
4.2.3 Méthodes d’amplification isotherme .12
5 Exigences imposées aux laboratoires.13
5.1 Généralités .13
5.2 Exigences de biosécurité .13
5.2.1 Au sein du laboratoire . 13
5.2.2 Maîtrise des risques . 13
5.2.3 Équipement de protection individuelle (EPI) . 14
5.3 Configuration générale du laboratoire . 14
5.4 Appareillage . 14
5.5 Personnel de laboratoire . 14
6 Conception et développement . .15
6.1 Besoins des clients, des patients et des parties prenantes . 15
6.2 Usage prévu de l’analyse . 15
6.3 Stratégie institutionnelle .15
6.3.1 Tests développés en laboratoire (LDT) et dispositifs médicaux de
diagnostic in vitro (dispositifs médicaux de DIV) .15
6.3.2 Autorisation d’utilisation d’urgence . 16
6.4 Stratégie clinique . . 16
6.5 Spécification des besoins de conception et de développement . 17
6.5.1 Préanalyse des spécimens respiratoires en vue du dépistage du SARS-CoV-2 . 17
6.5.2 Spécifications de conception de l’analyse (spécifications de l’analyse). 24
6.5.3 Gestion du risque de conception .30
6.6 Optimisation des réactifs et des méthodes .30
6.6.1 Sélection des séquences cibles du SARS-CoV-2 .30
6.6.2 Impact potentiel de variants préoccupants sur la qualité des méthodes
diagnostiques des TAAN pour la détection du SARS-CoV-2. 31
6.6.3 Sélection des méthodes d’amplification . 31
6.6.4 Conception et sélection des amorces. 31
6.6.5 Optimisation du système réactionnel . 32
6.6.6 Détermination des valeurs seuils . 32
6.6.7 Vérification et validation de la conception de l’essai. 32
7 Vérification en vue de la prise en charge des patients .34
7.1 Généralités .34
7.2 Confirmation des caractéristiques de performance analytique .34
7.2.1 Exactitude.34
7.2.2 Limite de détection (LD) . 35
7.2.3 Inclusivité . 35
7.2.4 Spécificité . 36
iii
7.2.5 Robustesse . 36
7.3 Preuves cliniques . . 36
8 Validation en vue de la prise en charge des patients .37
8.1 Critères généraux . 37
8.2 Clarification de l’usage prévu . 37
8.3 Performance avec des échantillons ou des spécimens cliniques . 37
9 Transfert de la conception à la production .38
10 Mise en œuvre et utilisation en laboratoire et publication des résultats .38
10.1 Mise en œuvre et utilisation en laboratoire .38
10.2 Publication et interprétation des résultats .39
11 Assurance qualité .40
11.1 Surveillance de la performance .40
11.2 Changement de conception, y compris optimisation de l’analyse .40
11.3 Comparaison interlaboratoires . 41
Annexe A (informative) Techniques d’amplification de l’acide nucléique .42
Bibliographie .45
iv
Avant-propos
L’ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d’organismes
nationaux de normalisation (comités membres de l’ISO). L’élaboration des Normes internationales est
en général confiée aux comités techniques de l’ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude
a le droit de faire partie du comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales,
gouvernementales et non gouvernementales, en liaison avec l’ISO participent également aux travaux.
L’ISO collabore étroitement avec la Commission électrotechnique internationale (IEC) en ce qui
concerne la normalisation électrotechnique.
Les procédures utilisées pour élaborer le présent document et celles destinées à sa mise à jour sont
décrites dans les Directives ISO/IEC, Partie 1. Il convient, en particulier de prendre note des différents
critères d’approbation requis pour les différents types de documents ISO. Le présent document
a été rédigé conformément aux règles de rédaction données dans les Directives ISO/IEC, Partie 2
(voir www.iso.org/directives).
L’attention est attirée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l’objet de
droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L’ISO ne saurait être tenue pour responsable
de ne pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence. Les détails concernant
les références aux droits de propriété intellectuelle ou autres droits analogues identifiés lors de
l’élaboration du document sont indiqués dans l’Introduction et/ou dans la liste des déclarations de
brevets reçues par l’ISO (voir www.iso.org/brevets).
Les appellations commerciales éventuellement mentionnées dans le présent document sont données
pour information, par souci de commodité, à l’intention des utilisateurs et ne sauraient c
...


ISO/TC 212
Date :  2022-06-13
Deleted: 04
ISO/TC 212/JGT 6
Secrétariat :  ANSI
Systèmes d’essai pour diagnostic in vitro — Exigences et recommandations pour la détection du
coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) au moyen de méthodes
d’amplification de l’acide nucléique
In vitro diagnostic test systems — Requirements and recommendations for detection of severe
acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) by nucleic acid amplification methods
ICS : 11.100.01
Type du document :  Spécification technique
Sous-type du document :
Stade du document :  (60) Publication
Langue du document :  F
DOCUMENT PROTÉGÉ PAR COPYRIGHT
Deleted:
Droits de reproduction réservés. Sauf indication contraire, aucune partie de cette publication ne
peut être reproduite ni utilisée sous quelque forme que ce soit et par aucun procédé, électronique
ou mécanique, y compris la photocopie, l’affichage sur l’internet ou sur un Intranet, sans
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l’adresse ci-après ou au comité membre de l’ISO dans le pays du demandeur.
ISO copyright office
Ch. de Blandonnet 8 • CP 401 Deleted: •
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Fax + 41 22 749 09 47
copyright@iso.org
www.iso.org
Publié en Suisse
2 © ISO 2022 – Tous droits réservés

Sommaire Page
Avant-propos . v Deleted: 5
Introduction . vi
Deleted: 6
1 Domaine d'application . 1 Deleted: 8
2 Références normatives . 1 Deleted: 8
3 Termes et définitions . 1 Deleted: 8
4 Vue d’ensemble . 16
4.1 SARS-CoV-2 . 16
4.1.1 Généralités . 16
4.1.2 Préanalyse . 18
4.1.3 Analyse — Vue d’ensemble . 18
4.1.4 Phase postanalytique . 20
4.2 Méthodes d’amplification de l’acide nucléique . 21
4.2.1 qPCR à transcription inverse (RT-qPCR) . 21
4.2.2 PCR numérique à transcription inverse (RT-dPCR) . 21
4.2.3 Méthodes d’amplification isotherme. 22
5 Exigences imposées aux laboratoires . 22
5.1 Généralités . 22
5.2 Exigences de biosécurité . 22
5.2.1 Au sein du laboratoire . 22
5.2.2 Maîtrise des risques . 23
5.2.3 Équipement de protection individuelle (EPI) . 23
5.3 Configuration générale du laboratoire . 24
5.4 Appareillage . 24
5.5 Personnel de laboratoire . 24
6 Conception et développement. 24
6.1 Besoins des clients, des patients et des parties prenantes . 24
6.2 Usage prévu de l’analyse . 25
6.3 Stratégie institutionnelle . 25
6.3.1 Tests développés en laboratoire (LDT) et dispositifs médicaux de diagnostic in vitro
(dispositifs médicaux de DIV) . 25
6.3.2 Autorisation d’utilisation d’urgence . 26
6.4 Stratégie clinique . 26
6.5 Spécification des besoins de conception et de développement . 26
6.5.1 Préanalyse des spécimens respiratoires en vue du dépistage du SARS-CoV-2 . 26
6.5.2 Spécifications de conception de l’analyse (spécifications de l’analyse) . 34
6.5.3 Gestion du risque de conception . 41
6.6 Optimisation des réactifs et des méthodes . 41
6.6.1 Sélection des séquences cibles du SARS-CoV-2 . 41
6.6.2 Impact potentiel de variants préoccupants sur la qualité des méthodes
diagnostiques des TAAN pour la détection du SARS-CoV-2 . 42
6.6.3 Sélection des méthodes d’amplification . 42
6.6.4 Conception et sélection des amorces . 42
6.6.5 Optimisation du système réactionnel . 43
6.6.6 Détermination des valeurs seuils . 43
6.6.7 Vérification et validation de la conception de l’essai . 43
7 Vérification en vue de la prise en charge des patients . 45
7.1 Généralités. 45
7.2 Confirmation des caractéristiques de performance analytique . 46
7.2.1 Exactitude . 46
7.2.2 Limite de détection (LD) . 46
7.2.3 Inclusivité . 47
7.2.4 Spécificité . 47
7.2.5 Robustesse . 47
7.3 Preuves cliniques . 48
8 Validation en vue de la prise en charge des patients . 48
8.1 Critères généraux . 48
8.2 Clarification de l’usage prévu . 48
8.3 Performance avec des échantillons ou des spécimens cliniques . 49
9 Transfert de la conception à la production . 49
10 Mise en œuvre et utilisation en laboratoire et publication des résultats . 49
10.1 Mise en œuvre et utilisation en laboratoire . 49
10.2 Publication et interprétation des résultats . 50
11 Assurance qualité . 51
11.1 Surveillance de la performance . 51
11.2 Changement de conception, y compris optimisation de l’analyse . 52
11.3 Comparaison interlaboratoires . 52
Annexe A (informative) Techniques d’amplification de l’acide nucléique . 54
Bibliographie . 57
4 © ISO 2022 – Tous droits réservés

Avant-propos
L’ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d’organismes
nationaux de normalisation (comités membres de l’ISO). L’élaboration des Normes internationales est
en général confiée aux comités techniques de l’ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude a le
droit de faire partie du comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales,
gouvernementales et non gouvernementales, en liaison avec l’ISO participent également aux travaux.
L’ISO collabore étroitement avec la Commission électrotechnique internationale (IEC) en ce qui
concerne la normalisation électrotechnique.
Les procédures utilisées pour élaborer le présent document et celles destinées à sa mise à jour sont
décrites dans les Directives ISO/IEC, Partie 1. Il convient, en particulier de prendre note des différents
critères d’approbation requis pour les différents types de documents ISO. Le présent document a été
rédigé conformément aux règles de rédaction données dans les Directives ISO/IEC, Partie 2
(voir www.iso.org/directives).
L’attention est attirée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l’objet de
droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L’ISO ne saurait être tenue pour responsable
de ne pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence. Les détails concernant les
références aux droits de propriété intellectuelle ou autres droits analogues identifiés lors de
l’élaboration du document sont indiqués dans l’Introduction et/ou dans la liste des déclarations de
brevets reçues par l’ISO (voir www.iso.org/brevets).
Les appellations commerciales éventuellement mentionnées dans le présent document sont données
pour information, par souci de commodité, à l’intention des utilisateurs et ne sauraient constituer un
engagement.
Pour une explication de la nature volontaire des normes, la signification des termes et expressions
spécifiques de l’ISO liés à l’évaluation de la conformité, ou pour toute information au sujet de l’adhésion
de l’ISO aux principes de l’Organisation mondiale du commerce (OMC) concernant les obstacles
techniques au commerce (OTC), voir le lien suivant : www.iso.org/iso/fr/avant-propos.
Le présent document a été élaboré par le comité technique ISO/TC 212, Laboratoires de biologie
médicale et systèmes de diagnostic in vitro, en collaboration avec le comité technique ISO/TC 276,
Biotechnologie.
Il convient que l’utilisateur adresse tout retour d’information ou toute question concernant le présent
document à l’organisme national de normalisation de son pays. Une liste exhaustive desdits organismes
se trouve à l’adresse www.iso.org/fr/members.html.
Introduction
Les coronavirus sont des virus à ARN enveloppés qui sont largement répandus dans le règne animal.
Ils ont
...

Questions, Comments and Discussion

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