ISO 23118:2021

NORME ISO
INTERNATIONALE 23118
Première édition
2021-05
Analyses de diagnostic moléculaire
in vitro — Spécifications relatives
aux processus préanalytiques pour
l'analyse du métabolome dans l'urine
et le sang veineux (sérum et plasma)
Molecular in vitro diagnostic examinations — Specifications for pre-
examination processes in metabolomics in urine, venous blood serum
and plasma
Numéro de référence
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ISO 2021
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Sommaire Page
Avant-propos .iv
Introduction .v
1 Domaine d’application . 1
2 Références normatives . 1
3 Termes et définitions . 1
4 Considérations générales . 3
5 Urine . 4
5.1 En dehors du laboratoire . 4
5.1.1 Prélèvement d’urine . 4
5.1.2 Exigences relatives au transport . 5
5.2 Au sein du laboratoire . 6
5.2.1 Réception des échantillons . 6
5.2.2 Exigences relatives au stockage . 6
5.2.3 Traitement des échantillons d’urine . 6
5.2.4 Exigences relatives au stockage à long terme des échantillons d’urine . 6
5.2.5 Décongélation de l’urine . 7
6 Sang . 7
6.1 En dehors du laboratoire . 7
6.1.1 Prélèvement primaire . 7
6.1.2 Transport des échantillons prétraités vers le laboratoire . 9
6.2 Au sein du laboratoire . 9
6.2.1 Réception des échantillons . 9
6.2.2 Traitement des échantillons . 9
6.2.3 Transport des échantillons traités vers un laboratoire en vue de l’analyse
métabolomique ou transport vers une biobanque .10
6.2.4 Exigences relatives au stockage à long terme .10
6.2.5 Décongélation et utilisation du sérum et du plasma .10
Annexe A (informative) Instabilité du métabolome .11
Bibliographie .17
Avant-propos
L’ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d’organismes
nationaux de normalisation (comités membres de l’ISO). L’élaboration des Normes internationales est
en général confiée aux comités techniques de l’ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude
a le droit de faire partie du comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales,
gouvernementales et non gouvernementales, en liaison avec l’ISO participent également aux travaux.
L’ISO collabore étroitement avec la Commission électrotechnique internationale (IEC) en ce qui
concerne la normalisation électrotechnique.
Les procédures utilisées pour élaborer le présent document et celles destinées à sa mise à jour sont
décrites dans les Directives ISO/IEC, Partie 1. Il convient, en particulier de prendre note des différents
critères d’approbation requis pour les différents types de documents ISO. Le présent document a été
rédigé conformément aux règles de rédaction données dans les Directives ISO/IEC, Partie 2 (voir www
.iso .org/ directives).
L’attention est attirée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l’objet de
droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L’ISO ne saurait être tenue pour responsable
de ne pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence. Les détails concernant
les références aux droits de propriété intellectuelle ou autres droits analogues identifiés lors de
l’élaboration du document sont indiqués dans l’Introduction et/ou dans la liste des déclarations de
brevets rédigées par l’ISO (voir www .iso .org/ brevets).
Les appellations commerciales éventuellement mentionnées dans le présent document sont données
pour information, par souci de commodité, à l’intention des utilisateurs et ne sauraient constituer un
engagement.
Pour une explication de la nature volontaire des normes, de la signification des termes et expressions
spécifiques de l’ISO liés à l’évaluation de la conformité, ou pour toute autre information au sujet de
l’adhésion de l’ISO aux principes de l’Organisation mondiale du commerce (OMC) concernant les
obstacles techniques au commerce (OTC), voir le lien suivant: www .iso .org/ iso/ fr/ avant -propos .html.
Le présent document a été élaboré par le comité technique ISO/TC 212, Laboratoires d’analyses de
biologie médicale et systèmes de diagnostic in vitro, en collaboration avec le comité technique CEN/TC 140,
Dispositifs médicaux de diagnostic in vitro du Comité européen de normalisation (CEN), conformément à
l’Accord de coopération technique entre l’ISO et le CEN (Accord de Vienne).
Il convient que l’utilisateur adresse tout retour d’information ou toute question concernant le présent
document à l’organisme national de normalisation de son pays. Une liste exhaustive desdits organismes
se trouve à l’adresse www .iso .org/ members .html.
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Introduction
La métabolomique est la science -omique qui couvre la caractérisation du métabolome, lui-même
défini comme étant l’ensemble des petites molécules (masse moléculaire < 2 000 Da) dans un certain
[1]
système biologique tel qu’une cellule, un tissu, un organe ou un organisme entier . Les analyses sont
généralement effectuées à l’aide de deux techniques analytiques principales, à savoir la spectrométrie
[2][3][4]
de masse (SM) et la résonance magnétique nucléaire (RMN) . La première a une sensibilité très
faible de l’ordre du picomolaire. Elle nécessite une séparation des échantillons et plusieurs séries
d’expériences ciblant des classes de composés spécifiques. La dernière mesure les métabolites présents
à une concentration supérieure à 1 µM et sert principalement au cours d’analyses non ciblées dans
lesquelles tous les métabolites au-dessus de la limite de détection sont observés simultanément, quelle
que soit leur nature chimique, sans séparation.
Le métabolome est dynamique et assez sensible aux perturbations. Le métabolome peut nettement
changer pendant le prélèvement, le transport, le stockage et le traitement d’échantillons primaires. Par
conséquent, le résultat du diagnostic et des recherches peut devenir une représentation non fiable de
l’état physiologique ciblé spécifique ou de l’instant donné, mais décrit au contraire un profil artificiel
généré pendant le processus préanalytique. On a identifié que les variations préanalytiques avaient
deux origines principales:
a) l’activité enzymatique dans les échantillons, généralement liée à la présence de cellules;
b) les réactions chimiques (par exemple, réactions d’oxydoréduction) dans les métabolites ou entre
les métabolites et l’oxygène, voir les Références [5] à [11].
De plus, les analyses peuvent être influencées par l’utilisation d’additifs ou par l’introduction de
contaminants. Par conséquent, il est capital de choisir des tubes de prélèvement et un matériel en
plastique appropriés lors de la phase préanalytique.
Des études ont été menées pour établir les meilleures méthodes préanalytiques en termes de
préservation du métabolome de l’échantillon d’origine en identifiant les étapes cruciales et les
paramètres affectant la composition du métabolome. De plus, il est nécessaire de standardiser
l’ensemble du processus préanalytique pour assurer la comparabilité des études multicentriques.
Dans l’état actuel des connaissances, aucune méthode préanalytique n’est définie pour les échantillons
métabolomiques. Par conséquent, les méthodes adoptées par les différents centres influencent
grandement le métabolome des échantillons, ce qui rend leur comparaison non fiable. L’adoption des
présentes exigences pour la phase préanalytique permet de comparer et d’évaluer les résultats obtenus
avec l’analyse métabolomique.
Le présent document s’appuie sur ces études pour codifier et standardiser les étapes de l’analyse
métabolomique de l’urine, du sérum et du plasma en phase dite préanalytique.
NORME INTERNATIONALE ISO 23118:2021(F)
Analyses de diagnostic moléculaire in vitro —
Spécifications relatives aux processus préanalytiques pour
l'analyse du métabolome dans l'urine et le sang veineux
(sérum et plasma)
1 Domaine d’application
Le présent document spécifie les exigences et donne des recommandations concernant la manipulation,
la documentation et le traitement de l’urine et du sang veineux (plasma et sérum) destinés à l’analyse
métabolomique lors du processus préanalytique. Le présent document est applicable aux analyses
métabolomiques et peut être utilisé par les laboratoires biomédicaux, les clients de laboratoires, les
développeurs et fabricants de diagnostics in vitro, les organismes et sociétés de recherche biomédicale,
les biobanques et les autorités réglementaires.
2 Références normatives
Les documents suivants sont cités dans le texte de sorte qu’ils constituent, pour tout ou partie de leur
contenu, des exigences du présent document. Pour les références datées, seule l’édition citée s’applique.
Pour les références non datées, la dernière édition du document de référence s'applique (y compris les
éventuels amendements).
ISO 15189, Laboratoires de biologie médicale — Exigences concernant la qualité et la compétence
ISO 15190, Laboratoires de biologie médicale — Exigences pour la sécurité
3 Termes et définitions
Pour les besoins du présent document, les termes et définitions donnés dans l’ISO 15189 ainsi que les
suivants s’appliquent.
L’ISO et l’IEC tiennent à jour des bases de données terminologiques destinées à être utilisées en
normalisation, consultables aux adresses suivantes:
— ISO Online browsing platform: disponible à l’adresse https:// www .iso .org/ obp
— IEC Electropedia: disponible à l’adresse https:// www .electropedia .org/
3.1
biofluide
fluide biologique qui peut être excrété (tel que l’urine ou la sueur), sécrété (tel que le lait maternel, la
salive ou la bile), obtenu à l’aide d’une aiguille (tel que le sang ou le liquide céphalorachidien) ou produit
suite à un processus pathologique (tel qu’une ampoule ou un liquide cystique)
3.2
analyse
ensemble des opérations destinées à déterminer la valeur ou les caractéristiques d’une propriété
Note 1 à l'article: à l’Article Les processus débutent avec l’analyte extrait et comprennent toutes sortes d’essais
paramétriques ou une manipulation chimique en vue de réaliser l’analyse quantitative ou qualitative.
Note 2 à l'article: à l’Article Pour l’analyse métabolomique, l’extraction de l’analyte n’est pas nécessairement
requise.
[SOURCE: ISO 20166-1:2018, 3.10, modifiée — le terme admis «phase analytique» a été supprimé et la
Note 2 à l’article a été ajoutée.]
3.3
jeûne
abstinence d’ingestion de nourriture solide ou liquide pendant au moins 8 heures
3.4
spectrométrie de masse
SM
méthode utilisée pour analyser les composés chimiques d’après leur rapport masse/charge
3.5
profilage métabolique
utilisation de plateformes analytiques pour mesurer simultanément l’ensemble des métabolites (3.6)
dans des systèmes biologiques qui peuvent être mesurés par la technique employée (ou sélectionnée)
EXEMPLE La RMN et la SM sont des exemples de techniques.
3.6
métabolites
petites molécules (≤ 2 000 Da) qui sont des intermédiaires et/ou produits du métabolisme des
organismes hôtes, de sa microflore, provenant de nourriture, de boissons, de médicaments ou de
polluants
Note 1 à l'article: à l’Article Pour plus d’informations, voir la Référence [1].
3.7
métabolome
ensemble complet de métabolites (3.6) contenus dans un organisme ou dans un échantillon biologique
Note 1 à l'article: à l’Article Pour plus d’informations, voir la Référence [1].
3.8
métabolomique
analyse exhaustive du métabolome (3.7) d’un échantillon (3.14) biologique (par exemple, organisme,
cellule, tissu ou biofluides (3.1))
3.9
métabolomique par SM
utilisation de la spectrométrie de masse (3.4) pour mesurer les métabolites (3.6) dans des échantillons
biologiques
3.10
spectroscopie par résonance magnétique nucléaire
RMN
méthode reposant sur l’absorption sélective d’ondes radioélectriques haute fréquence par des noyaux
atomiques soumis à un champ magnétique constant
Note 1 à l'article: à l’Article La RMN permet d’obtenir les propriétés chimiques et structurelles des molécules.
3.11
métabolomique par RMN
utilisation de la spectroscopie par RMN (3.10) pour mesurer les métabolites (3.6) dans des échantillons
biologiques
3.12
plasma
partie liquide du sang non coagulé
Note 1 à l'article: à l’Article Les échantillons de plasma peuvent contenir des anticoagulants.
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3.13
processus préanalytiques
phase préanalytique
flux de travail préanalytique
processus commençant chronologiquement par la prescription des analyses par le clinicien, comprenant
la demande d’analyse (3.2), la préparation et l’identification du patient, le prélèvement de l’échantillon
primaire, son stockage temporaire, son acheminement jusqu’au laboratoire et au sein du laboratoire,
son aliquotage et son extraction
Note 1 à l'article: à l’Article La phase préanalytique peut comprendre des processus de préparation qui peuvent
influencer le résultat de l’analyse (3.2) prévue.
[SOURCE: ISO 15189:2012, 3.15, modifiée — Un terme supplémentaire a été ajouté et d’autres
informations ont été intégrées.]
3.14
échantillon primaire
spécimen
partie discrète d’un liquide corporel, d’une haleine, d’un cheveu ou d’un tissu prélevé à des fins d’analyse
(3.2), d’étude ou d’examen d’une ou plusieurs grandeurs ou propriétés pour déterminer le caractère de
l’ensemble
[SOURCE: ISO 15189:2012, 3.16, modifiée — Le terme et la définition sont utilisés ici sans les notes
d’origine.]
3.15
température ambiante
température définie entre 18 °C et 25 °C pour les besoins du présent document
3.16
sérum
liquide qui peut être séparé du sang coagulé
3.17
stabilité
caractéristique d’un matériau de référence, lorsqu’il est entreposé dans des conditions spécifiées, à
conserver une valeur de propriété spécifiée dans des limites spécifiées pendant une période de temps
spécifiée
[SOURCE: Guide ISO 30:2015, 2.1.15 — Le terme et la définition sont utilisés ici sans la note d’origine.]
4 Considérations générales
Pour les considérations générales sur les systèmes de management de la qualité des laboratoires
médicaux et, en particulier, sur le prélèvement, la réception et la manipulation des échantillons (y
compris la prévention de la contamination croisée), voir l’ISO 15189 ou l’ISO/IEC 17020. Les exigences
relatives à l’équipement, aux réactifs et aux consommables de laboratoire conformément à l’ISO 15189
doivent être respectées; l’ISO/IEC 17020 peut également s’appliquer.
Toutes les étapes du processus de diagnostic peuvent influencer le résultat final de l’essai analytique et
une évaluation des risques doit être effectuée (voir également l’ISO 14971). Des mesures d’élimination
ou de réduction des risques identifiés doivent être établies, le cas échéant, pour assurer le bon
déroulement de l’analyse. Il faut notamment étudier et vérifier que les métabolites destinés à être
analysés ne sont pas compromis d’une manière affectant le bon déroulement de l’analyse. Cela peut
être effectué, par exemple, en appliquant l’analyse prévue aux spécimens/échantillons qui ont subi
des études temporelles reflétant chaque étape du processus préanalytique telles que le transport et
le stockage, et en mettant en œuvre des mesures de prévention ou de réduction des impacts par les
variables préanalytiques identifiées.
En l’absence de technologies adaptées de stabilisation des échantillons, concernant le métabolome, le
prélèvement d’échantillons doit être effectué à l’hôpital ou dans des établissements où des méthodes
appropriées de traitement des biofluides sont immédiatement disponibles.
En particulier, pour les échantillons destinés à subir une analyse métabolomique, les étapes suivantes
doivent être prises en compte:
a) prétraitement du patient (jeûne, thérapie, etc.);
b) prélèvement de l’échantillon sur le patient;
c) sélection de récipients et d’emballages de prélèvement (par exemple, tubes de prélèvement, boîte
réfrigérante, boîte de stockage et boîte de transport);
d) sélection de méthodes de stabilisation (par exemple, tout composé ajouté pour stabiliser
l’échantillon);
e) consignation des ajouts ou modifications de l’échantillon;
f) consignation des types et de la quantité, et description des échantillons.
Les exigences de sécurité relatives au stockage, au transport et à la manipulation doivent être prises en
compte conformément à l’ISO 15189 et à l’ISO 15190. Il convient de respecter le Guide de l’OMS sur la
[14]
sécurité du transport des matières infectieuses et des échantillons de diagnostic .
5 Urine
5.1 En dehors du laboratoire
5.1.1 Prélèvement d’urine
5.1.1.1 Généralités
Pour le prélèvement de l’échantillon, les exigences (par exemple, état pathologique, taille d’échantillon)
relatives à l’analyse moléculaire prévue doivent être prises en compte.
Voir également l’ISO 15189.
5.1.1.2 Informations sur le donneur d’échantillons/patient
La documentation doit inclure l’identifiant du donneur d’échantillons/patient, qui peut avoir la forme
d’un code.
Il convient que la documentation comprenne, entre autres:
a) l’état de santé et les facteurs liés au mode de vie du donneur d’urine [par exemple, en bonne santé,
type de maladie, maladie(s) concomitante(s)];
b) les caractéristiques démographiques (par exemple, âge, sexe);
c) les informations sur le traitement médical et sur tout traitement précédent le prélèvement d’urine
(par exemple, anesthésiques, médicaments, méthodes de diagnostic);
d) l’heure du prélèvement, y compris des informations sur le jeûne, les activités antérieures;
e) le consentement approprié du donneur d’échantillons/patient.
5.1.1.3 Sélection et étiquetage des récipients de prélèvement
Le laboratoire doit définir le récipient destiné au prélèvement d’urine.
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Généralement, aucun additif n’est utilisé car il peut interférer avec la méthode analytique. Si nécessaire,
pour des besoins spécifiques, leur impact sur les performances et les résultats analytiques doit être
analysé. Certains additifs présents dans les tubes de prélèvement peuvent être dangereux pour les
patients (toxiques ou corrosifs par exemple).
Pour l’étiquetage (identification des échantillons) du tube de prélèvement d’urine, une méthode de
routine (voir également l’ISO 15189) ou une méthode incluant des informations supplémentaires (par
exemple, code-barres 2D) doit être utilisée.
5.1.1.4 Prélèvement et réception d’urine en provenance du donneur d’échantillons
5.1.1.4.1 Généralités
Des instructions de prélèvement d’urine doivent être fournies au donneur, y compris les mesures
de sécurité à respecter lors de la manipulation des récipients de prélèvement contenant des additifs
dangereux. Il convient de s’assurer que tous les dispositifs de prélèvement d’urine sont compatibles
avec la métabolomique, par exemple en évitant toute interférence avec le profil métabolique.
NOTE Pour les enfants qui ne vont pas tout seuls aux toilettes, la méthode non invasive la plus courante est la
technique «clean catch», définie comme étant la référence absolue par le National Institute for Health and Clinical
Excellence (NICE), 2007. Cette méthode consiste à récupérer un échantillon en tenant un flacon d’échantillon
stérile sous le jet d’urine. Les poches et les compresses de prélèvement d’urine peuvent également être utilisées
pour prélever l’urine. L’institut NICE estime que les compresses de prélèvement d’urine constituent la meilleure
option pour effectuer la technique «clean catch».
Il convient que les premières urines à mi-jet du matin soient prélevées après un jeûne d’au moins 8 h.
L’ingestion de boissons peut influencer les concentrations en métabolites. Cela nécessite une
normalisation. Préciser si le prélèvement a été effectué à différents moments ou s’il s’agit d’un
prélèvement sur 24 h. Tout écart par rapport aux instructions doit être validé. Le jeûne permet
d’effectuer l’analyse métabolomique de l’urine lorsque les donneurs ayant les mêmes conditions
métaboliques sont synchronisés. Les recherches ou les essais analytiques dédiés peuvent nécessiter
différentes conditions chez les patients.
Un volume suffisant d’urine doit être prélevé conformément aux exigences des étapes de préparation
préanalytiques et à l’essai analytique.
Toute intervention clinique affectant le prélèvement des échantillons doit être documentée. Le volume
prélevé total doit être documenté.
5.1.1.4.2 Informations sur les échantillons d’urine et exigences de stockage sur le site de
prélèvement d’urine
Étant donné que les profils métaboliques peuvent changer après le prélèvement d’urine et ainsi affecter
la validité et la fiabilité du résultat de l’essai analytique, la documentation sur l’échantillon primaire
d’urine doit inclure l’heure et la date de prélèvement de l’urine.
Il convient de conserver tout l’échantillon d’urine au réfrigérateur entre 2 °C et 8 °C pendant 2 h
maximum et de ne pas le congeler avant centrifugation et/ou filtration, pour éviter toute perturbation
cellulaire due à la formation de cristaux de glace, sauf si l’essai analytique fournit des indications
différentes.
La durée totale autorisée pour le stockage de l’échantillon d’urine comprend la durée de stockage sur le
site de prélèvement d’urine, le transport vers le laboratoire d’essai et le stockage au sein du laboratoire
d’essai ou d’autres établissements.
5.1.2 Exigences relatives au transport
Pendant le transport, il convient de conserver l’échantillon dans un endroit réfrigéré (entre 2 °C et 8 °C).
Des mesures appropriées doivent être prises pour respecter les limites de température et pour réduire
le temps de livraison, qui ne doit pas dépasser 2 h après prélèvement.
La déclaration de conformité de la méthode de transport doit être documentée. Tout écart par rapport
au protocole doit être décrit et documenté.
Il convient de respecter le Guide de l’OMS sur la sécurité du transport des matières infectieuses et des
[14]
échantillons de diagnostic .
5.2 Au sein du laboratoire
5.2.1 Réception des échantillons
L’heure de réception des échantillons d’urine et les conditions (par exemple, étiquetage, conditions de
transport, volume, fuite et précipitation) des échantillons reçus doivent être documentées. Toute non-
conformité de l’étiquetage, des conditions de transport et des différences de volumes d’urine avec les
exigences décrites pour le prélèvement d’urine ou la préparation des échantillons doit être documentée.
En cas de non-conformité des conditions de transport, du temps de stockage et de transport ou du
[7][8][9]
volume d’urine susceptible d’affecter la validité et la fiabilité du résultat de l’essai analytique , il
convient de prélever un nouvel échantillon.
Si l’essai analytique l’exige, il convient d’évaluer les propriétés de l’écha
...