ISO/TR 17622:2015

RAPPORT ISO/TR
TECHNIQUE 17622
Première édition
2015-11-01
Analyse moléculaire de
biomarqueurs — Méthode d’analyse
SSR sur le tournesol
Molecular biomarker analysis — SSR analysis of sunflower
Numéro de référence
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ISO 2015
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Sommaire Page
Avant-propos .iv
Introduction .v
1 Domaine d’application . 1
2 Principe . 1
3 Consommables et équipements . 1
4 Mode opératoire. 1
4.1 Préparation de l’échantillon . 1
4.2 Extraction et quantification de l’ADN . 1
4.3 Amplification par PCR. 2
5 Liste établie de marqueurs SSR pour le contrôle de la conformité des variétés
hybrides de tournesol . 3
5.1 Caractéristiques des marqueurs SSR . 3
5.2 Séquence des amorces des marqueurs SSR . 4
5.3 Profils SSR observés sur les lignées de tournesol . 5
Bibliographie . 6
Avant-propos
L’ISO (Organisation internationale de normalisation) est une fédération mondiale d’organismes
nationaux de normalisation (comités membres de l’ISO). L’élaboration des Normes internationales est
en général confiée aux comités techniques de l’ISO. Chaque comité membre intéressé par une étude
a le droit de faire partie du comité technique créé à cet effet. Les organisations internationales,
gouvernementales et non gouvernementales, en liaison avec l’ISO participent également aux travaux.
L’ISO collabore étroitement avec la Commission électrotechnique internationale (IEC) en ce qui
concerne la normalisation électrotechnique.
Les procédures utilisées pour élaborer le présent document et celles destinées à sa mise à jour sont
décrites dans les Directives ISO/IEC, Partie 1. Il convient, en particulier, de prendre note des différents
critères d’approbation requis pour les différents types de documents ISO. Le présent document a été
rédigé conformément aux règles de rédaction données dans les Directives ISO/IEC, Partie 2 (voir www.
iso.org/directives).
L’attention est appelée sur le fait que certains des éléments du présent document peuvent faire l’objet de
droits de propriété intellectuelle ou de droits analogues. L’ISO ne saurait être tenue pour responsable
de ne pas avoir identifié de tels droits de propriété et averti de leur existence. Les détails concernant
les références aux droits de propriété intellectuelle ou autres droits analogues identifiés lors de
l’élaboration du document sont indiqués dans l’Introduction et/ou dans la liste des déclarations de
brevets reçues par l’ISO (voir www.iso.org/brevets).
Les appellations commerciales éventuellement mentionnées dans le présent document sont données
pour information, par souci de commodité, à l’intention des utilisateurs et ne sauraient constituer
un engagement.
Pour une explication de la signification des termes et expressions spécifiques de l’ISO liés à
l’évaluation de la conformité, ou pour toute information au sujet de l’adhésion de l’ISO aux principes
de l’OMC concernant les obstacles techniques au commerce (OTC), voir le lien suivant: Avant-propos —
Informations supplémentaires.
Le comité chargé de l’élaboration du présent document est l’ISO/TC 34, Produits alimentaires, Sous-
comité SC 16, Méthodes horizontales pour l’analyse moléculaire de biomarqueurs.
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Introduction
Les essais d’identification variétale nécessitent l’utilisation de marqueurs de haute qualité qui
permettent d’obtenir des données reproductibles à l’aide de différents équipements, produits chimiques
et réactifs. Par conséquent, le présent Rapport technique ne traite que de méthodes d’amplification
spécifiques du tournesol.
Le présent Rapport technique vise à fournir une liste de marqueurs SSR («simple sequence repeat»
en anglais, répétition de séquences simples) et des méthodes d’analyse applicables au tournesol.
Le jeu de marqueurs SSR a été établi sur la base de recommandations formulées par des biologistes
moléculaires à l’aide de listes de marqueurs accessibles au public (pour les marqueurs ORS: Tang et al.,
2002: TAG 105:1124-1136 et pour les marqueurs SSL: GIE Cartisol – Paris – France); ce jeu a ensuite été
validé au moyen d’une étude intralaboratoire menée par le GEVES (Laboratoire BioGEVES, Domaine
du Magneraud, CS40052, 17700 SURGERES). La méthode est utilisée lors des contrôles officiels de la
conformité des hybrides, dans le cadre du processus d’inscription des variétés de tournesol au catalogue
français des variétés.
Le présent document est lié à l’ISO 13495, dans laquelle les différentes étapes de la validation de la
méthode sont décrites, et dans laquelle les critères d’acceptation sont définis.
RAPPORT TECHNIQUE ISO/TR 17622:2015(F)
Analyse moléculaire de biomarqueurs — Méthode
d’analyse SSR sur le tournesol
1 Domaine d’application
Les méthodes et les marqueurs SSR décrits dans le présent Rapport technique peuvent être utilisés
pour réaliser des contrôles de la conformité des hybrides et pour d’autres applications telles que la
caractérisation moléculaire des variétés ou le contrôle d’identité variétale.
2 Principe
L’analyse SSR repose sur l’amplification d’une séquence et
...